系统开发部负责Magic Linux的开发和维护。现在由6个小组组成，分别如下：

1、系统文档组：用户手册的撰写和更新。

2、系统支持组：文档翻译、问题解答、FAQ整理、用户手册编写、以用户代表身份编写ML应用解决方案等。

3、系统测试组：硬件测试、软件测试；兼容性测试、稳定性测试、性能测试、以各类用户代表身份进行评价。

4、系统计划组：需求调研、需求征集、反馈意见整理、需求管理和版本计划、其他发行版观察员、以各类用户代表身份提出需求。

5、系统开发组：安装程序开发、配置程序开发、自主应用开发、错误修正和软件包维护、其他发行版移植、升级补丁包开发、版本控制。

6、系统资源组：软件搜集、软件汉化、桌面背景制作、窗口装饰制作、桌面图标制作、其他发行版观察员/移植员。

网站开发部负责Magic Linux官方网站的开发和日常维护工作。现在由2个小组组成，分别如下：

1、网站维护组：网站的日常维护和更新。

2、网站开发组：网站修复和开发。

管理协调部主要协助不同部门和组之间的管理和协调工作。